og måtene som infeksjonen sprer seg på kan være forskjellige. Koloniseringen formidlet av patogener kan faktisk skje gjennom:
- Stigende rute fra blæren (den hyppigste): fra perineum (eller fra vaginal vestibyl, for kvinnelige pasienter), går mikroorganismer opp i urinrøret, deretter i blæren, opp til nyrene; hovedårsakene av infeksjon for kvinner består i deformasjon av urinrøret under samleie, mens det for menn ofte er sekundært til prostatitt. Hos kateteriserte pasienter kan forurensning oppstå etter plassering eller manipulering av kateteret, med påfølgende mulig stigning av patogener i blæren .
- Blod synkende rute: gjennom blodet, i løpet av septikemi, når patogenene til nyrene og forårsaker nefritt og nyreabcesser.
- Nedadgående lymfatisk vei: et nettverk av lymfekar forbinder det stigende tykktarmen med høyre nyre og det synkende tykktarmen med venstre nyre.
Mikroorganismer som er involvert i pyelonefrit er vanligvis de samme som er ansvarlige for infeksjoner i urinveiene, i kjønnsorganene og mage -tarmkanalen, derfor i blæren, prostata, livmorhalsen, skjeden, urinrøret eller endetarmen: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Enterococcus spp. etc.
I de fleste tilfeller representerer disse patogenene bakteriene i fekalfloraen, som tar den stigende ruten, selv om peristaltikk generelt (bevegelser av sammentrekninger og distensjon av veggene i urinveiene) utfører en "effektiv beskyttende handling mot infeksjoner.
Noen ganger er det rapportert om andre uvanlige mikroorganismer: mykobakterier, gjær og sopp, samt opportunistiske patogener som f.eks. Corynebacterium urealyticum.