Vanlige aminosyrer og proteinsyntese
Aminosyrene som forekommer hyppigst i proteinstrukturene til levende organismer kalles vanlige eller proteinogene aminosyrer. Selv om over 500 typer aminosyrer er kjent i naturen, er det bare tjue som vi kaller vanlige. Sammen med dem er det noen sjeldnere, som kalles sporadiske, som vanligvis stammer fra metabolismen til vanlige etter at de ble innlemmet i proteinkjeden. I kollagen finnes for eksempel lysin og prolin, to vanlige aminosyrer, i hydroksylert form (hydroksyprolin og hydroksylisin).
De fleste av de andre ikke-vanlige aminosyrene faller hovedsakelig innenfor konstitueringen av enzymer og hormoner av proteinkarakter, eller rettere sagt peptid (husk at for å bli sett på som dette, må et protein bestå av mer enn 100 aminosyrer, mens danner henholdsvis et oligo og et polypeptid 2 til 9 og 10 til 100).
Blant de 20 vanlige aminosyrene huskes
Alanin, arginin, asparagin, asparaginsyre, cystein, glycin, glutaminsyre, glutamin, histidin, isoleucin, leucin, lysin, metionin, fenylalanin, proline, serin, treonin, tryptofan, tyrosin, valin
Eksempler på ikke-vanlige aminosyrer er:
karnitin (involvert i transport av langkjedede fettsyrer inne i mitokondrien, hvor de brukes til å produsere energi);
ornitin, citrullin og homocystein (deltar i metabolismen av aminosyrer - urinsyklus);
hydroksyprolin og hydroksylisin (de er en del av sammensetningen av kollagen og noen proteiner);
sarkosin (eller metylglycin).
Noen aminosyrer kan også ha kommersiell eller farmakologisk betydning.
- Natriumglutamat brukes i næringsmiddelindustrien som en smakforsterker (se buljongterning).
- L-dihydroksyfenylalanin (L-DOPA) er et stoff som brukes til behandling av Parkinsons sykdom.
- 5-hydroksytryptofan (5-HTP) har blitt brukt til behandling av nevrologiske symptomer forbundet med fenylketonuri (en arvelig metabolsk sykdom som forhindrer bruk av fenylalanin, en essensiell aminosyre, på grunn av spesielle enzymatiske underskudd; akkumulering av fenylalanin i vevet er ansvarlig for alvorlig hud og nevrologisk skade).
Planter og bakterier er i stand til å produsere bestemte aminosyrer, som finnes i peptidantibiotika, for eksempel nisin og alameticin.
Essensielle aminosyrer
Noen av de 20 vanlige aminosyrene kalles essensielle, da de ikke kan syntetiseres av kroppen fra andre forbindelser, men må tas med mat.
For mennesker er disse fenylalanin, leucin, isoleucin, lysin, metionin, treonin, tryptofan, valin, og hos barn histidin og arginin.
Vanlige aminosyrer, kjemiske egenskaper
Basert på de kjemiske egenskapene til R -radikalet (gruppe av atomer som danner en ikke veldig lang kjede), kan aminosyrer deles inn i forskjellige kategorier.
Aminosyrer med apolar R (ikke i stand til å danne hydrogenbindinger):
med alifatisk kjede: alanin, leucin, isoleucin, valin, prolin
med aromatisk kjede: fenylalanin, tryptofan
med en kjede som inneholder et svovelatom: metionin
Aminosyrer med polar R:
med OH -gruppe: serin, treonin, tyrosin
med SH -gruppe: cystein
med CO-NH2-gruppe: asparagin, glutamin
med H: glycin (den eneste ikke-kirale aminosyren)
Aminosyrer med grunnleggende R:
lysin, arginin, histidin
Aminosyrer med syre R:
glutaminsyre, asparaginsyre
