Den normale funksjonen til calprotectin er derfor å motvirke utviklingen av bakterier og sopp inne i kroppen (antimikrobiell aktivitet).
I nærvær av en "betennelse i mage -tarmkanalen migrerer de hvite blodlegemene til det og frigjør proteinet, hvis konsentrasjon i avføringen øker tilsvarende.
Av denne grunn kan calprotectin brukes som en indikator på betennelse i tilfeller av kroniske tarmsykdommer, noen infeksjoner av bakteriell opprinnelse eller kreft i fordøyelsessystemet.
Den fekale doseringen av calprotectin er den eneste testen som kan gi informasjon om plasseringen av betennelsen. Bestemmelsen av parameteren i plasma, derimot, fremhever en inflammatorisk tilstand som kan lokaliseres hvor som helst. Videre er doseringen av fekal kalprotektin en gyldig indeks for graden av betennelse hos pasienter med kroniske inflammatoriske tarmsykdommer (som ulcerøs kolitt og Crohns sykdom).
; tilstede i alle deler av menneskekroppen, er den hovedsakelig konsentrert i cytoplasma av nøytrofile granulocytter.I lavere konsentrasjoner er calprotectin også tilstede i monocytter og i makrofager som stammer fra dem; disse cellene, som ligner på nøytrofiler, er hvite blodlegemer designet for å fagocytisere - derfor å englobere, fordøye og ødelegge - fremmede partikler som har trengt inn i organismen, inkludert mikroorganismer (som neutrofiler er mer aktive mot).
Både nøytrofile og makrofager har evnen til å utskille kjemiske mediatorer av den inflammatoriske responsen.
Innenfor disse immuncellene viser kalprotektin høy bakteriostatisk og mykostatisk aktivitet; som sådan motvirker det effektivt veksten av sopp og bakterier.